El desarrollo de ejercicio investigativo se fundamenta en la tesis. El estudiante cuenta con cuatro seminarios de investigación para diseñar su Proyecto de Tesis y consolidar su formación específica en metodología de la investigación en sentido estricto, con un director y dos tutores, que conforman el Comité Tutorial, y lo acompañan durante todo el proceso. Tres jurados evalúan tanto el Proyecto de Tesis como la Tesis. El director y los jurados están vinculados a la Universidad con remuneración.

Al finalizar su investigación, la tesis se somete a una defensa pública donde se expone y debate, con la posibilidad de aplazamiento si no cumple con lo esperado. Dependiendo del interés institucional, algunos de los resultados se divulgan en diferentes medios de comunicación. Las tesis generan productos académicos como metodologías, reportes, artículos, ponencias, libros, prototipos o patentes. Toda tesis se considera como producto intelectual de la Universidad y se rige por las normas y leyes de la Propiedad Intelectual. La tesis se registra en los sistemas informáticos dispuestos para ello.